Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRNQ9P2B2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms