Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCMF1Q9P0J7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms