Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TMOD2Q9NZR1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD2Q9NZR1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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