Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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