Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NINJ2Q9NZG7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms