Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms