Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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RRN3Q9NYV6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RRN3Q9NYV6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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