Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CDK12Q9NYV4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms