Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMOD3Q9NYL9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms