Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR4Q9NYA4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms