Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms