Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms