Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms