Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD4Q9NXE4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms