Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB20Q9NX57 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms