Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCIQ9NVI1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCIQ9NVI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms