Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms