Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCAF13Q9NV06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCAF13Q9NV06 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms