Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDS5BQ9NTI5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms