Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms