Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms