Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms