Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELLSQ9NRZ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms