Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms