Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms