Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms