Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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