Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms