Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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