Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms