Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX4

TRPC7, Short transient receptor potential channel 7, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC7Q9HCX4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC7Q9HCX4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC7Q9HCX4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms