Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms