Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF2Q9HAK2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms