Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL44Q9H9J2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL44Q9H9J2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms