Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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