Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms