Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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