Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms