Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms