Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNMDQ9H2S6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms