Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCL3Q9H2J4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms