Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDT1Q9H211 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms