Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NYXQ9GZU5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NYXQ9GZU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms