Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms