Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms