Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP6Q9GZR1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms