Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms