Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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