Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms