Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TDRD1Q9BXT4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD1Q9BXT4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD1Q9BXT4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD1Q9BXT4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD1Q9BXT4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms